北海综合保税区规划面积为2.28平方公里，共分为两个区块。A区规划面积为1.14平方公里，位于北海市区西侧，紧靠北海港，距离北海站5公里，距离高速公路入口17公里，距离北海机场约20公里； B区规划面积1.14平方公里，位于北海市铁山港区，距铁山港仅3公里，紧靠玉铁高速公路，距福成机场30公里。

北海综合保税区具备保税加工、保税物流、保税服务的功能优势和“先行先试”的政策优势，同时具备“保税加工、保税物流、口岸”三大功能和“产品研发、加工制造、商品展示、售后维修服务、仓储物流和分销配送、国际中转与对外贸易”八项业务功能；同时享有北海国家高新技术产品全球入境维修/再制造示范区、广西CEPA先行先试示范基地、海关特殊监管区域企业增值税一般纳税人资格试点等叠加的优惠政策和国家西部大开发优惠政策、民族区域自治优惠政策、广西北部湾经济区开放开发优惠政策、广西优惠政策、北海市优惠政策等多重优惠政策，政策优势明显。